Table 1 Outline of primers for IL1A, IL1B SNP genotyping
Gene | SNP ID | Polymorphisms | Forward primer | Reverse primer | Un-extension primer |
|---|---|---|---|---|---|
(5′-3′) | (5′-3′) | (5′-3′) | |||
IL1A | rs1304037 | A > G | ACGTTGGATGTCGATTAAGAGTTCATCAGC | ACGTTGGATGAGCCACAGACCTAGGATTTC | AGTTCATCAGCAACTTAAAAG |
rs16347 | DEL > TGAA | ACGTTGGATGGTAGGACTTGATTGCAGGTG | ACGTTGGATGTTGAGCCAGTAATTGGTCCG | TGCAGGTGGAATTGAA | |
rs17561 | G > T | ACGTTGGATGGGTTTTAGAAATCATCAAGCC | ACGTTGGATGGAATTCGTATTTGATGATCC | TCATCAAGCCTAGGTCA | |
rs2071373 | C > T | ACGTTGGATGTGATGTGCATTGGCTTCTCC | ACGTTGGATGAACATCCTGATGAAGCCTGC | TCCCAGAACAGAGCAGAAC | |
IL1B | rs1143623 | G > C | ACGTTGGATGATGTGCCAGGTATCGTGCTC | ACGTTGGATGACCTATTTCCCTCGTGTCTC | GCTCGCTCTGCATTAT |
rs3917345 | DEL > TGGT | ACGTTGGATGTGCTGGTGTCTCGGTTAAAG | ACGTTGGATGTCTGAGACTCTATCTCTTGG | AGAGAAACTGATAACTCTTGGT | |
rs1143627 | T > C | ACGTTGGARGCCTCGAAGAGGTTTGGTATC | ACGTTGGATGTCTAGCCTCCTACTTCTGC | ATCCCTCGCTGTTTTTAT |