TY - JOUR AU - Deeks, S. G. AU - Tracy, R. AU - Douek, D. C. PY - 2013 DA - 2013// TI - Systemic effects of inflammation on health during chronic HIV infection JO - Immunity VL - 39 UR - https://doi.org/10.1016/j.immuni.2013.10.001 DO - 10.1016/j.immuni.2013.10.001 ID - Deeks2013 ER - TY - JOUR AU - Brenchley, J. M. AU - Price, D. A. AU - Schacker, T. W. AU - Asher, T. E. AU - Silvestri, G. AU - Rao, S. AU - Kazzaz, Z. AU - Bornstein, E. AU - Lambotte, O. AU - Altmann, D. PY - 2006 DA - 2006// TI - Microbial translocation is a cause of systemic immune activation in chronic HIV infection JO - Nat Med VL - 12 UR - https://doi.org/10.1038/nm1511 DO - 10.1038/nm1511 ID - Brenchley2006 ER - TY - JOUR AU - d'Ettorre, G. AU - Paiardini, M. AU - Ceccarelli, G. AU - Silvestri, G. AU - Vullo, V. PY - 2011 DA - 2011// TI - HIV-associated immune activation: from bench to bedside JO - AIDS Res Hum Retrovir VL - 27 UR - https://doi.org/10.1089/aid.2010.0342 DO - 10.1089/aid.2010.0342 ID - d'Ettorre2011 ER - TY - JOUR AU - Suresh, D. R. AU - Annam, V. AU - Pratibha, K. AU - Prasad, B. V. PY - 2009 DA - 2009// TI - Total antioxidant capacity--a novel early bio-chemical marker of oxidative stress in HIV infected individuals JO - J Biomed Sci VL - 16 UR - https://doi.org/10.1186/1423-0127-16-61 DO - 10.1186/1423-0127-16-61 ID - Suresh2009 ER - TY - JOUR AU - Masia, M. AU - Padilla, S. AU - Fernandez, M. AU - Rodriguez, C. AU - Moreno, A. AU - Oteo, J. A. AU - Antela, A. AU - Moreno, S. AU - Amo, J. AU - Gutierrez, F. PY - 2016 DA - 2016// TI - Oxidative stress predicts all-cause mortality in HIV-infected patients JO - PLoS One VL - 11 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pone.0153456 DO - 10.1371/journal.pone.0153456 ID - Masia2016 ER - TY - JOUR AU - Ivanov, A. V. AU - Valuev-Elliston, V. T. AU - Ivanova, O. N. AU - Kochetkov, S. N. AU - Starodubova, E. S. AU - Bartosch, B. AU - Isaguliants, M. G. PY - 2016 DA - 2016// TI - Oxidative stress during HIV infection: mechanisms and consequences JO - Oxidative Med Cell Longev VL - 2016 UR - https://doi.org/10.1155/2016/8910396 DO - 10.1155/2016/8910396 ID - Ivanov2016 ER - TY - JOUR AU - Toro, J. AU - Herschlik, L. AU - Waldner, C. AU - Mongini, C. PY - 2015 DA - 2015// TI - Emerging roles of exosomes in normal and pathological conditions: new insights for diagnosis and therapeutic applications JO - Front Immunol VL - 6 UR - https://doi.org/10.3389/fimmu.2015.00389 DO - 10.3389/fimmu.2015.00389 ID - Toro2015 ER - TY - JOUR AU - Abels, E. R. AU - Breakefield, X. O. PY - 2016 DA - 2016// TI - Introduction to extracellular vesicles: biogenesis, RNA cargo selection, content, release, and uptake JO - Cell Mol Neurobiol VL - 36 UR - https://doi.org/10.1007/s10571-016-0366-z DO - 10.1007/s10571-016-0366-z ID - Abels2016 ER - TY - STD TI - Yu X, Odenthal M, Fries JW. Exosomes as miRNA carriers: formation-function-future. Int J Mol Sci. 2016;17(12):2028. ID - ref9 ER - TY - JOUR AU - Kadiu, I. AU - Narayanasamy, P. AU - Dash, P. K. AU - Zhang, W. AU - Gendelman, H. E. PY - 2012 DA - 2012// TI - Biochemical and biologic characterization of exosomes and microvesicles as facilitators of HIV-1 infection in macrophages JO - J Immunol VL - 189 UR - https://doi.org/10.4049/jimmunol.1102244 DO - 10.4049/jimmunol.1102244 ID - Kadiu2012 ER - TY - JOUR AU - Hubert, A. AU - Subra, C. AU - Jenabian, M. A. AU - Tremblay Labrecque, P. F. AU - Tremblay, C. AU - Laffont, B. AU - Provost, P. AU - Routy, J. P. AU - Gilbert, C. PY - 2015 DA - 2015// TI - Elevated abundance, size, and MicroRNA content of plasma extracellular vesicles in Viremic HIV-1+ patients: correlations with known markers of disease progression JO - J Acquir Immune Defic Syndr VL - 70 UR - https://doi.org/10.1097/QAI.0000000000000756 DO - 10.1097/QAI.0000000000000756 ID - Hubert2015 ER - TY - JOUR AU - Chettimada, S. AU - Lorenz, D. R. AU - Misra, V. AU - Dillon, S. T. AU - Reeves, R. K. AU - Manickam, C. AU - Morgello, S. AU - Kirk, G. D. AU - Mehta, S. H. AU - Gabuzda, D. PY - 2018 DA - 2018// TI - Exosome markers associated with immune activation and oxidative stress in HIV patients on antiretroviral therapy JO - Sci Rep VL - 8 UR - https://doi.org/10.1038/s41598-018-25515-4 DO - 10.1038/s41598-018-25515-4 ID - Chettimada2018 ER - TY - JOUR AU - Lenassi, M. AU - Cagney, G. AU - Liao, M. AU - Vaupotic, T. AU - Bartholomeeusen, K. AU - Cheng, Y. AU - Krogan, N. J. AU - Plemenitas, A. AU - Peterlin, B. M. PY - 2010 DA - 2010// TI - HIV Nef is secreted in exosomes and triggers apoptosis in bystander CD4+ T cells JO - Traffic VL - 11 UR - https://doi.org/10.1111/j.1600-0854.2009.01006.x DO - 10.1111/j.1600-0854.2009.01006.x ID - Lenassi2010 ER - TY - JOUR AU - Fang, Y. AU - Wu, N. AU - Gan, X. AU - Yan, W. AU - Morrell, J. C. AU - Gould, S. J. PY - 2007 DA - 2007// TI - Higher-order oligomerization targets plasma membrane proteins and HIV gag to exosomes JO - PLoS Biol VL - 5 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pbio.0050158 DO - 10.1371/journal.pbio.0050158 ID - Fang2007 ER - TY - JOUR AU - Narayanan, A. AU - Iordanskiy, S. AU - Das, R. AU - Duyne, R. AU - Santos, S. AU - Jaworski, E. AU - Guendel, I. AU - Sampey, G. AU - Dalby, E. AU - Iglesias-Ussel, M. PY - 2013 DA - 2013// TI - Exosomes derived from HIV-1-infected cells contain trans-activation response element RNA JO - J Biol Chem VL - 288 UR - https://doi.org/10.1074/jbc.M112.438895 DO - 10.1074/jbc.M112.438895 ID - Narayanan2013 ER - TY - JOUR AU - Konadu, K. A. AU - Chu, J. AU - Huang, M. B. AU - Amancha, P. K. AU - Armstrong, W. AU - Powell, M. D. AU - Villinger, F. AU - Bond, V. C. PY - 2015 DA - 2015// TI - Association of Cytokines with Exosomes in the plasma of HIV-1-seropositive individuals JO - J Infect Dis VL - 211 UR - https://doi.org/10.1093/infdis/jiu676 DO - 10.1093/infdis/jiu676 ID - Konadu2015 ER - TY - JOUR AU - Khatua, A. K. AU - Taylor, H. E. AU - Hildreth, J. E. AU - Popik, W. PY - 2009 DA - 2009// TI - Exosomes packaging APOBEC3G confer human immunodeficiency virus resistance to recipient cells JO - J Virol VL - 83 UR - https://doi.org/10.1128/JVI.01658-08 DO - 10.1128/JVI.01658-08 ID - Khatua2009 ER - TY - STD TI - Yao Z, Qiao Y, Li X, Chen J, Ding J, Bai L, Shen F, Shi B, Liu J, Peng L, et al. Exosomes exploit the virus entry machinery and pathway to transmit alpha interferon-induced antiviral activity. J Virol. 2018;92(24):01578–18. ID - ref18 ER - TY - JOUR AU - Boelens, M. C. AU - Wu, T. J. AU - Nabet, B. Y. AU - Xu, B. AU - Qiu, Y. AU - Yoon, T. AU - Azzam, D. J. AU - Twyman-Saint Victor, C. AU - Wiemann, B. Z. AU - Ishwaran, H. PY - 2014 DA - 2014// TI - Exosome transfer from stromal to breast cancer cells regulates therapy resistance pathways JO - Cell VL - 159 UR - https://doi.org/10.1016/j.cell.2014.09.051 DO - 10.1016/j.cell.2014.09.051 ID - Boelens2014 ER - TY - JOUR AU - Murray, D. D. AU - Suzuki, K. AU - Law, M. AU - Trebicka, J. AU - Neuhaus Nordwall, J. AU - Johnson, M. AU - Vjecha, M. J. AU - Kelleher, A. D. AU - Emery, S. PY - 2017 DA - 2017// TI - Circulating miR-122 and miR-200a as biomarkers for fatal liver disease in ART-treated, HIV-1-infected individuals JO - Sci Rep VL - 7 UR - https://doi.org/10.1038/s41598-017-11405-8 DO - 10.1038/s41598-017-11405-8 ID - Murray2017 ER - TY - JOUR AU - O'Meara, T. AU - Kong, Y. AU - Chiarella, J. AU - Price, R. W. AU - Chaudhury, R. AU - Liu, X. AU - Spudich, S. AU - Robertson, K. AU - Emu, B. AU - Lu, L. PY - 2019 DA - 2019// TI - Exosomal MicroRNAs associate with neuropsychological performance in individuals with HIV infection on antiretroviral therapy JO - J Acquir Immune Defic Syndr VL - 82 UR - https://doi.org/10.1097/QAI.0000000000002187 DO - 10.1097/QAI.0000000000002187 ID - O'Meara2019 ER - TY - JOUR AU - Rozowsky, J. AU - Kitchen, R. R. AU - Park, J. J. AU - Galeev, T. R. AU - Diao, J. AU - Warrell, J. AU - Thistlethwaite, W. AU - Subramanian, S. L. AU - Milosavljevic, A. AU - Gerstein, M. PY - 2019 DA - 2019// TI - exceRpt: a comprehensive analytic platform for extracellular RNA profiling JO - Cell Syst VL - 8 UR - https://doi.org/10.1016/j.cels.2019.03.004 DO - 10.1016/j.cels.2019.03.004 ID - Rozowsky2019 ER - TY - JOUR AU - Chiang, K. AU - Sung, T. L. AU - Rice, A. P. PY - 2012 DA - 2012// TI - Regulation of cyclin T1 and HIV-1 replication by microRNAs in resting CD4+ T lymphocytes JO - J Virol VL - 86 UR - https://doi.org/10.1128/JVI.05065-11 DO - 10.1128/JVI.05065-11 ID - Chiang2012 ER - TY - JOUR AU - Piedade, D. AU - Azevedo-Pereira, J. M. PY - 2016 DA - 2016// TI - MicroRNAs, HIV and HCV: a complex relation towards pathology JO - Rev Med Virol VL - 26 UR - https://doi.org/10.1002/rmv.1881 DO - 10.1002/rmv.1881 ID - Piedade2016 ER - TY - JOUR AU - Huang, J. AU - Wang, F. AU - Argyris, E. AU - Chen, K. AU - Liang, Z. AU - Tian, H. AU - Huang, W. AU - Squires, K. AU - Verlinghieri, G. AU - Zhang, H. PY - 2007 DA - 2007// TI - Cellular microRNAs contribute to HIV-1 latency in resting primary CD4+ T lymphocytes JO - Nat Med VL - 13 UR - https://doi.org/10.1038/nm1639 DO - 10.1038/nm1639 ID - Huang2007 ER - TY - JOUR AU - Whisnant, A. W. AU - Bogerd, H. P. AU - Flores, O. AU - Ho, P. AU - Powers, J. G. AU - Sharova, N. AU - Stevenson, M. AU - Chen, C. H. AU - Cullen, B. R. PY - 2013 DA - 2013// TI - In-depth analysis of the interaction of HIV-1 with cellular microRNA biogenesis and effector mechanisms JO - MBio VL - 4 UR - https://doi.org/10.1128/mBio.00193-13 DO - 10.1128/mBio.00193-13 ID - Whisnant2013 ER - TY - JOUR AU - Parikh, V. N. AU - Park, J. AU - Nikolic, I. AU - Channick, R. AU - Yu, P. B. AU - Marco, T. AU - Hsue, P. Y. AU - Chan, S. Y. PY - 2015 DA - 2015// TI - Brief report: coordinated modulation of circulating miR-21 in HIV, HIV-associated pulmonary arterial hypertension, and HIV/hepatitis C virus Coinfection JO - J Acquir Immune Defic Syndr VL - 70 UR - https://doi.org/10.1097/QAI.0000000000000741 DO - 10.1097/QAI.0000000000000741 ID - Parikh2015 ER - TY - JOUR AU - Hulsmans, M. AU - Keyzer, D. AU - Holvoet, P. PY - 2011 DA - 2011// TI - MicroRNAs regulating oxidative stress and inflammation in relation to obesity and atherosclerosis JO - FASEB J VL - 25 UR - https://doi.org/10.1096/fj.11-181149 DO - 10.1096/fj.11-181149 ID - Hulsmans2011 ER - TY - JOUR AU - Rastogi, N. AU - Gara, R. K. AU - Trivedi, R. AU - Singh, A. AU - Dixit, P. AU - Maurya, R. AU - Duggal, S. AU - Bhatt, M. L. AU - Singh, S. AU - Mishra, D. P. PY - 2014 DA - 2014// TI - (6)-Gingerolinduced myeloid leukemia cell death is initiated by reactive oxygen species and activation of miR-27b expression JO - Free Radic Biol Med VL - 68 UR - https://doi.org/10.1016/j.freeradbiomed.2013.12.016 DO - 10.1016/j.freeradbiomed.2013.12.016 ID - Rastogi2014 ER - TY - JOUR AU - Simionescu, N. AU - Niculescu, L. S. AU - Sanda, G. M. AU - Margina, D. AU - Sima, A. V. PY - 2014 DA - 2014// TI - Analysis of circulating microRNAs that are specifically increased in hyperlipidemic and/or hyperglycemic sera JO - Mol Biol Rep VL - 41 UR - https://doi.org/10.1007/s11033-014-3449-2 DO - 10.1007/s11033-014-3449-2 ID - Simionescu2014 ER - TY - JOUR AU - Engedal, N. AU - Zerovnik, E. AU - Rudov, A. AU - Galli, F. AU - Olivieri, F. AU - Procopio, A. D. AU - Rippo, M. R. AU - Monsurro, V. AU - Betti, M. AU - Albertini, M. C. PY - 2018 DA - 2018// TI - From oxidative stress damage to pathways, networks, and autophagy via MicroRNAs JO - Oxidative Med Cell Longev VL - 2018 UR - https://doi.org/10.1155/2018/4968321 DO - 10.1155/2018/4968321 ID - Engedal2018 ER - TY - JOUR AU - Neilsen, C. T. AU - Goodall, G. J. AU - Bracken, C. P. PY - 2012 DA - 2012// TI - IsomiRs--the overlooked repertoire in the dynamic microRNAome JO - Trends Genet VL - 28 UR - https://doi.org/10.1016/j.tig.2012.07.005 DO - 10.1016/j.tig.2012.07.005 ID - Neilsen2012 ER - TY - JOUR AU - Karimi, N. AU - Cvjetkovic, A. AU - Jang, S. C. AU - Crescitelli, R. AU - Hosseinpour Feizi, M. A. AU - Nieuwland, R. AU - Lotvall, J. AU - Lasser, C. PY - 2018 DA - 2018// TI - Detailed analysis of the plasma extracellular vesicle proteome after separation from lipoproteins JO - Cell Mol Life Sci VL - 75 UR - https://doi.org/10.1007/s00018-018-2773-4 DO - 10.1007/s00018-018-2773-4 ID - Karimi2018 ER - TY - JOUR AU - Li, L. AU - Zhu, D. AU - Huang, L. AU - Zhang, J. AU - Bian, Z. AU - Chen, X. AU - Liu, Y. AU - Zhang, C. Y. AU - Zen, K. PY - 2012 DA - 2012// TI - Argonaute 2 complexes selectively protect the circulating microRNAs in cell-secreted microvesicles JO - PLoS One VL - 7 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pone.0046957 DO - 10.1371/journal.pone.0046957 ID - Li2012 ER - TY - JOUR AU - Vickers, K. C. AU - Palmisano, B. T. AU - Shoucri, B. M. AU - Shamburek, R. D. AU - Remaley, A. T. PY - 2011 DA - 2011// TI - MicroRNAs are transported in plasma and delivered to recipient cells by high-density lipoproteins JO - Nat Cell Biol VL - 13 UR - https://doi.org/10.1038/ncb2210 DO - 10.1038/ncb2210 ID - Vickers2011 ER - TY - JOUR AU - Fuchs, D. AU - Forsman, A. AU - Hagberg, L. AU - Larsson, M. AU - Norkrans, G. AU - Reibnegger, G. AU - Werner, E. R. AU - Wachter, H. PY - 1990 DA - 1990// TI - Immune activation and decreased tryptophan in patients with HIV-1 infection JO - J Interf Res VL - 10 UR - https://doi.org/10.1089/jir.1990.10.599 DO - 10.1089/jir.1990.10.599 ID - Fuchs1990 ER - TY - JOUR AU - Huengsberg, M. AU - Winer, J. B. AU - Gompels, M. AU - Round, R. AU - Ross, J. AU - Shahmanesh, M. PY - 1998 DA - 1998// TI - Serum kynurenine-to-tryptophan ratio increases with progressive disease in HIV-infected patients JO - Clin Chem VL - 44 UR - https://doi.org/10.1093/clinchem/44.4.858 DO - 10.1093/clinchem/44.4.858 ID - Huengsberg1998 ER - TY - JOUR AU - Seymour, C. W. AU - Yende, S. AU - Scott, M. J. AU - Pribis, J. AU - Mohney, R. P. AU - Bell, L. N. AU - Chen, Y. F. AU - Zuckerbraun, B. S. AU - Bigbee, W. L. AU - Yealy, D. M. PY - 2013 DA - 2013// TI - Metabolomics in pneumonia and sepsis: an analysis of the GenIMS cohort study JO - Intensive Care Med VL - 39 UR - https://doi.org/10.1007/s00134-013-2935-7 DO - 10.1007/s00134-013-2935-7 ID - Seymour2013 ER - TY - JOUR AU - Kowalczyk-Pachel, D. AU - Iciek, M. AU - Wydra, K. AU - Nowak, E. AU - Gorny, M. AU - Filip, M. AU - Wlodek, L. AU - Lorenc-Koci, E. PY - 2016 DA - 2016// TI - Cysteine metabolism and oxidative processes in the rat liver and kidney after acute and repeated cocaine treatment JO - PLoS One VL - 11 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pone.0147238 DO - 10.1371/journal.pone.0147238 ID - Kowalczyk-Pachel2016 ER - TY - JOUR AU - Amorim, M. G. AU - Valieris, R. AU - Drummond, R. D. AU - Pizzi, M. P. AU - Freitas, V. M. AU - Sinigaglia-Coimbra, R. AU - Calin, G. A. AU - Pasqualini, R. AU - Arap, W. AU - Silva, I. T. PY - 2017 DA - 2017// TI - A total transcriptome profiling method for plasma-derived extracellular vesicles: applications for liquid biopsies JO - Sci Rep VL - 7 UR - https://doi.org/10.1038/s41598-017-14264-5 DO - 10.1038/s41598-017-14264-5 ID - Amorim2017 ER - TY - JOUR AU - Yuan, T. AU - Huang, X. AU - Woodcock, M. AU - Du, M. AU - Dittmar, R. AU - Wang, Y. AU - Tsai, S. AU - Kohli, M. AU - Boardman, L. AU - Patel, T. PY - 2016 DA - 2016// TI - Plasma extracellular RNA profiles in healthy and cancer patients JO - Sci Rep VL - 6 UR - https://doi.org/10.1038/srep19413 DO - 10.1038/srep19413 ID - Yuan2016 ER - TY - JOUR AU - El-Mogy, M. AU - Lam, B. AU - Haj-Ahmad, T. A. AU - McGowan, S. AU - Yu, D. AU - Nosal, L. AU - Rghei, N. AU - Roberts, P. AU - Haj-Ahmad, Y. PY - 2018 DA - 2018// TI - Diversity and signature of small RNA in different bodily fluids using next generation sequencing JO - BMC Genomics VL - 19 UR - https://doi.org/10.1186/s12864-018-4785-8 DO - 10.1186/s12864-018-4785-8 ID - El-Mogy2018 ER - TY - JOUR AU - Franco, S. AU - Buccione, D. AU - Pluvinet, R. AU - Mothe, B. AU - Ruiz, L. AU - Nevot, M. AU - Jordan-Paiz, A. AU - Ramos, L. AU - Ausso, S. AU - Morillas, R. M. PY - 2018 DA - 2018// TI - Large-scale screening of circulating microRNAs in individuals with HIV-1 mono-infections reveals specific liver damage signatures JO - Antivir Res VL - 155 UR - https://doi.org/10.1016/j.antiviral.2018.05.008 DO - 10.1016/j.antiviral.2018.05.008 ID - Franco2018 ER - TY - JOUR AU - Bandiera, S. AU - Pfeffer, S. AU - Baumert, T. F. AU - Zeisel, M. B. PY - 2015 DA - 2015// TI - miR-122--a key factor and therapeutic target in liver disease JO - J Hepatol VL - 62 UR - https://doi.org/10.1016/j.jhep.2014.10.004 DO - 10.1016/j.jhep.2014.10.004 ID - Bandiera2015 ER - TY - JOUR AU - Chen, A. K. AU - Sengupta, P. AU - Waki, K. AU - Engelenburg, S. B. AU - Ochiya, T. AU - Ablan, S. D. AU - Freed, E. O. AU - Lippincott-Schwartz, J. PY - 2014 DA - 2014// TI - MicroRNA binding to the HIV-1 gag protein inhibits gag assembly and virus production JO - Proc Natl Acad Sci U S A VL - 111 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.1408037111 DO - 10.1073/pnas.1408037111 ID - Chen2014 ER - TY - JOUR AU - Castro, F. O. F. AU - Silva, J. M. AU - Dorneles, G. P. AU - Barros, J. B. S. AU - Ribeiro, C. B. AU - Noronha, I. AU - Barbosa, G. R. AU - Souza, L. C. S. AU - Guilarde, A. O. AU - Pereira, A. PY - 2019 DA - 2019// TI - Distinct inflammatory profiles in HIV-infected individuals under antiretroviral therapy using cannabis, cocaine or cannabis plus cocaine JO - AIDS VL - 33 UR - https://doi.org/10.1097/QAD.0000000000002296 DO - 10.1097/QAD.0000000000002296 ID - Castro2019 ER - TY - JOUR AU - Cisneros, I. E. AU - Erdenizmenli, M. AU - Cunningham, K. A. AU - Paessler, S. AU - Dineley, K. T. PY - 2018 DA - 2018// TI - Cocaine evokes a profile of oxidative stress and impacts innate antiviral response pathways in astrocytes JO - Neuropharmacology VL - 135 UR - https://doi.org/10.1016/j.neuropharm.2018.03.019 DO - 10.1016/j.neuropharm.2018.03.019 ID - Cisneros2018 ER - TY - JOUR AU - Xiao, J. AU - Pan, Y. AU - Li, X. H. AU - Yang, X. Y. AU - Feng, Y. L. AU - Tan, H. H. AU - Jiang, L. AU - Feng, J. AU - Yu, X. Y. PY - 2016 DA - 2016// TI - Cardiac progenitor cell-derived exosomes prevent cardiomyocytes apoptosis through exosomal miR-21 by targeting PDCD4 JO - Cell Death Dis VL - 7 UR - https://doi.org/10.1038/cddis.2016.181 DO - 10.1038/cddis.2016.181 ID - Xiao2016 ER - TY - JOUR AU - Thulasingam, S. AU - Massilamany, C. AU - Gangaplara, A. AU - Dai, H. AU - Yarbaeva, S. AU - Subramaniam, S. AU - Riethoven, J. J. AU - Eudy, J. AU - Lou, M. AU - Reddy, J. PY - 2011 DA - 2011// TI - miR-27b*, an oxidative stress-responsive microRNA modulates nuclear factor-kB pathway in RAW 264.7 cells JO - Mol Cell Biochem VL - 352 UR - https://doi.org/10.1007/s11010-011-0752-2 DO - 10.1007/s11010-011-0752-2 ID - Thulasingam2011 ER - TY - JOUR AU - Whisnant, A. W. AU - Kehl, T. AU - Bao, Q. AU - Materniak, M. AU - Kuzmak, J. AU - Lochelt, M. AU - Cullen, B. R. PY - 2014 DA - 2014// TI - Identification of novel, highly expressed retroviral microRNAs in cells infected by bovine foamy virus JO - J Virol VL - 88 UR - https://doi.org/10.1128/JVI.03587-13 DO - 10.1128/JVI.03587-13 ID - Whisnant2014 ER - TY - JOUR AU - Taganov, K. D. AU - Boldin, M. P. AU - Chang, K. J. AU - Baltimore, D. PY - 2006 DA - 2006// TI - NF-kappaB-dependent induction of microRNA miR-146, an inhibitor targeted to signaling proteins of innate immune responses JO - Proc Natl Acad Sci U S A VL - 103 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.0605298103 DO - 10.1073/pnas.0605298103 ID - Taganov2006 ER - TY - JOUR AU - Pauley, K. M. AU - Satoh, M. AU - Pauley, B. A. AU - Dominguez-Gutierrez, P. R. AU - Wallet, S. M. AU - Holliday, L. S. AU - Cha, S. AU - Reeves, W. H. AU - Chan, E. K. PY - 2010 DA - 2010// TI - Formation of GW/P bodies as marker for microRNA-mediated regulation of innate immune signaling in THP-1 cells JO - Immunol Cell Biol VL - 88 UR - https://doi.org/10.1038/icb.2009.84 DO - 10.1038/icb.2009.84 ID - Pauley2010 ER - TY - JOUR AU - Hou, J. AU - Wang, P. AU - Lin, L. AU - Liu, X. AU - Ma, F. AU - An, H. AU - Wang, Z. AU - Cao, X. PY - 2009 DA - 2009// TI - MicroRNA-146a feedback inhibits RIG-I-dependent type I IFN production in macrophages by targeting TRAF6, IRAK1, and IRAK2 JO - J Immunol VL - 183 UR - https://doi.org/10.4049/jimmunol.0900707 DO - 10.4049/jimmunol.0900707 ID - Hou2009 ER - TY - JOUR AU - Geyer, P. E. AU - Kulak, N. A. AU - Pichler, G. AU - Holdt, L. M. AU - Teupser, D. AU - Mann, M. PY - 2016 DA - 2016// TI - Plasma proteome profiling to assess human health and disease JO - Cell Syst VL - 2 UR - https://doi.org/10.1016/j.cels.2016.02.015 DO - 10.1016/j.cels.2016.02.015 ID - Geyer2016 ER - TY - JOUR AU - Longatti, A. PY - 2015 DA - 2015// TI - The dual role of Exosomes in hepatitis a and C virus transmission and viral immune activation JO - Viruses VL - 7 UR - https://doi.org/10.3390/v7122967 DO - 10.3390/v7122967 ID - Longatti2015 ER - TY - JOUR AU - Petoumenos, K. AU - Law, M. G. PY - 2016 DA - 2016// TI - Smoking, alcohol and illicit drug use effects on survival in HIV-positive persons JO - Curr Opin HIV AIDS VL - 11 UR - https://doi.org/10.1097/COH.0000000000000306 DO - 10.1097/COH.0000000000000306 ID - Petoumenos2016 ER - TY - JOUR AU - Huang, X. AU - Yuan, T. AU - Tschannen, M. AU - Sun, Z. AU - Jacob, H. AU - Du, M. AU - Liang, M. AU - Dittmar, R. L. AU - Liu, Y. AU - Liang, M. PY - 2013 DA - 2013// TI - Characterization of human plasma-derived exosomal RNAs by deep sequencing JO - BMC Genomics VL - 14 UR - https://doi.org/10.1186/1471-2164-14-319 DO - 10.1186/1471-2164-14-319 ID - Huang2013 ER - TY - JOUR AU - Danielson, K. M. AU - Rubio, R. AU - Abderazzaq, F. AU - Das, S. AU - Wang, Y. E. PY - 2017 DA - 2017// TI - High throughput sequencing of extracellular RNA from human plasma JO - PLoS One VL - 12 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pone.0164644 DO - 10.1371/journal.pone.0164644 ID - Danielson2017 ER - TY - JOUR AU - Arroyo, J. D. AU - Chevillet, J. R. AU - Kroh, E. M. AU - Ruf, I. K. AU - Pritchard, C. C. AU - Gibson, D. F. AU - Mitchell, P. S. AU - Bennett, C. F. AU - Pogosova-Agadjanyan, E. L. AU - Stirewalt, D. L. PY - 2011 DA - 2011// TI - Argonaute2 complexes carry a population of circulating microRNAs independent of vesicles in human plasma JO - Proc Natl Acad Sci U S A VL - 108 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.1019055108 DO - 10.1073/pnas.1019055108 ID - Arroyo2011 ER - TY - JOUR AU - Backes, C. AU - Khaleeq, Q. T. AU - Meese, E. AU - Keller, A. PY - 2016 DA - 2016// TI - miEAA: microRNA enrichment analysis and annotation JO - Nucleic Acids Res VL - 44 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gkw345 DO - 10.1093/nar/gkw345 ID - Backes2016 ER - TY - JOUR AU - Tokar, T. AU - Pastrello, C. AU - Rossos, A. E. M. AU - Abovsky, M. AU - Hauschild, A. C. AU - Tsay, M. AU - Lu, R. AU - Jurisica, I. PY - 2018 DA - 2018// TI - mirDIP 4.1-integrative database of human microRNA target predictions JO - Nucleic Acids Res VL - 46 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gkx1144 DO - 10.1093/nar/gkx1144 ID - Tokar2018 ER - TY - JOUR AU - Sticht, C. AU - Torre, C. AU - Parveen, A. AU - Gretz, N. PY - 2018 DA - 2018// TI - miRWalk: An online resource for prediction of microRNA binding sites JO - PLoS One VL - 13 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pone.0206239 DO - 10.1371/journal.pone.0206239 ID - Sticht2018 ER - TY - JOUR AU - Chou, C. H. AU - Shrestha, S. AU - Yang, C. D. AU - Chang, N. W. AU - Lin, Y. L. AU - Liao, K. W. AU - Huang, W. C. AU - Sun, T. H. AU - Tu, S. J. AU - Lee, W. H. PY - 2018 DA - 2018// TI - miRTarBase update 2018: a resource for experimentally validated microRNA-target interactions JO - Nucleic Acids Res VL - 46 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gkx1067 DO - 10.1093/nar/gkx1067 ID - Chou2018 ER - TY - JOUR AU - Shannon, P. AU - Markiel, A. AU - Ozier, O. AU - Baliga, N. S. AU - Wang, J. T. AU - Ramage, D. AU - Amin, N. AU - Schwikowski, B. AU - Ideker, T. PY - 2003 DA - 2003// TI - Cytoscape: a software environment for integrated models of biomolecular interaction networks JO - Genome Res VL - 13 UR - https://doi.org/10.1101/gr.1239303 DO - 10.1101/gr.1239303 ID - Shannon2003 ER - TY - JOUR AU - Bindea, G. AU - Mlecnik, B. AU - Hackl, H. AU - Charoentong, P. AU - Tosolini, M. AU - Kirilovsky, A. AU - Fridman, W. H. AU - Pages, F. AU - Trajanoski, Z. AU - Galon, J. PY - 2009 DA - 2009// TI - ClueGO: a Cytoscape plug-in to decipher functionally grouped gene ontology and pathway annotation networks JO - Bioinformatics VL - 25 UR - https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btp101 DO - 10.1093/bioinformatics/btp101 ID - Bindea2009 ER -